野生狀態下，蛤蚧卵的孵化是靠自然溫度，孵化期的長短與環境溫度有密切關系，也與當年產卵期的早晚有密切關系。在７月１５日前產的卵，當年能孵出幼體的，稱當年孵化卵；當年７月１５日以后產的卵，在當年不能孵化出幼體的，稱越冬孵化卵。當年孵化卵孵化期在夏、秋兩季，溫度適宜，胚胎發育迅速，胚胎期９２～１１９天，平均１０５．１天，其積溫平均２８７５．６５℃；越冬卵胚胎發育期進入了一年中低溫期，胚胎發育遲緩，胚胎期２８０～３１５天，平均２９７．５天，積溫平均５７３８．０５℃，如去除冬眠期間的積溫，越冬孵化卵胚胎期實際為１１６～１３４天，平均１２５天，平均積溫２９６１．９℃。由此可見除去冬眠期，當年孵化卵與越冬孵化卵胚胎期和積溫相近。

胚胎發育特點與影響孵化的外部因素　實驗表明，蛤蚧胚胎發育進入第七天時，肉眼已能分辨出胚胎，在卵黃上有斑痕，外觀深灰色，用鑷子分離卵黃，可見到呈塊狀比較明顯的胚珠，長度約４毫米；進入第十天，已能分辨出頭部，兩黑色眼點清楚可見；胚胎發育５０天，觸之能動；胚胎發育９１天，卵黃基本消失或僅剩少許，胚胎發育完成，子蛤蚧在卵殼內呈蜷縮狀。

一個受精卵能否正常發育，除了卵本身的內在因素外，最主要的是外界環境因素，即溫度和濕度。孵化期的長短與孵化溫度有直接關系，在胚胎發育的溫度范圍內，溫度高時孵化期短；溫度低時孵化期長。胚胎發育的溫度為２０～３７℃。２０℃以下胚胎發育停止，２０～２５℃胚胎發育緩慢，２６～３７℃胚胎發育快，３８℃以上可造成胚胎發育死亡。胚胎發育最適宜的濕度７０％～８５％。實驗證明蛤蚧卵孵化相對濕度５０％～９０％均可，相對濕度在５０％以下，會使受精卵失去水分而影響胚胎發育；長期在相對濕度９０％以上，會造成受精卵發霉，也影響胚胎發育。所以，在人工孵化時，濕度應控制在７０％～８５％。