1、技術(shù)性貿(mào)易壁壘屢出現(xiàn)。自烏拉圭談判之后，日本以非關(guān)稅壁壘形式出現(xiàn)的技術(shù)貿(mào)易壁壘在中日食品貿(mào)易中的影響日益明顯，尤其是2006年5月29日，日本《肯定列表制度》實(shí)施以來，不斷修訂農(nóng)藥殘留限量。針對(duì)中國(guó)大豆農(nóng)殘超標(biāo)的問題，日本2012年采取了多項(xiàng)技術(shù)性貿(mào)易措施，加強(qiáng)了對(duì)中國(guó)大豆的檢驗(yàn)006-2012年出口日本大豆被扣留的原因呈品種增加、種類擴(kuò)大的趨勢(shì)，包括微生物、殺菌劑、殺蟲劑和除草劑。而造成我國(guó)輸出大豆被檢出不合格的原因主要是大腸桿菌、細(xì)菌等微生物招標(biāo)，2007年后主要是農(nóng)藥和微生物超標(biāo)，2012年殺菌劑苯醚甲環(huán)唑超標(biāo)占了較大比重。雖然我國(guó)近年采用許多應(yīng)對(duì)措施，并提高了標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)程度，但輸出日本大豆被扣的批次未見減少。 

2、價(jià)格相對(duì)較高。中國(guó)大豆價(jià)格較北美國(guó)家高，主要受以下因素影響：大豆主產(chǎn)區(qū)減產(chǎn)；種植成本逐年增加，如肥料等價(jià)格逐年上漲；國(guó)家收購儲(chǔ)備大豆的措施，使大豆價(jià)格上漲。日本實(shí)施肯定列表制度后，中國(guó)出口企業(yè)為了達(dá)到日本的檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)，新增了高科技的檢測(cè)設(shè)備，并新增了額外的檢測(cè)人員和檢測(cè)資金，這些成了出口企業(yè)新增的成本，大豆的出口價(jià)格也就因此上漲了。價(jià)格影響需求，中國(guó)大豆價(jià)格的提高會(huì)影響日本對(duì)其消費(fèi)量。    

3、來自他國(guó)大豆的競(jìng)爭(zhēng)。作為三大大豆出口國(guó)的美國(guó)、巴西和阿根廷擁有廣闊且肥沃的土地，且相對(duì)集中，便于機(jī)械化大規(guī)模生產(chǎn)，單產(chǎn)高。近年來，為了迎合日本市場(chǎng)對(duì)非轉(zhuǎn)基因大豆的需求，這些國(guó)家加大對(duì)農(nóng)業(yè)技術(shù)的投入，對(duì)大豆做了大量的優(yōu)秀品種改良，并研制高質(zhì)量低價(jià)格的具有國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)力的非轉(zhuǎn)基因大豆，以此打開日本市場(chǎng)。通過一系列措施來降低成本，像巴西政府把全國(guó)的豆農(nóng)組成農(nóng)場(chǎng)聯(lián)合體，負(fù)責(zé)統(tǒng)一購買種子、化肥等生產(chǎn)資料，既節(jié)約了成本，又有利于實(shí)現(xiàn)同品質(zhì)大豆規(guī)模化生產(chǎn)。這些原本只出口轉(zhuǎn)基因大豆的國(guó)家也加入了對(duì)日本出口非轉(zhuǎn)基因大豆，這樣中國(guó)大豆的優(yōu)勢(shì)就沒那么明顯了，甚至失去了競(jìng)爭(zhēng)力。   

4、定價(jià)機(jī)制不盡合理。在中國(guó)，只對(duì)特殊的大豆簽訂合同栽培，這些大豆可以提前（播種前）定價(jià)。在大豆收割前，農(nóng)民也不知道其單價(jià)，這使日本商社及廠家想購買時(shí)卻無法定價(jià)。這使客戶不會(huì)等著我國(guó)豆農(nóng)定價(jià)后買大豆，自然就去買其他國(guó)家的大豆了。