1、凍藏法：一般在東北地區使用，需在背風處挖一條溝，兩條通風道，通風道內還要擺放一些秸稈，將香菜放在秸稈上凍藏即可。2、窖藏法：窖藏又分堆藏與隙藏，貯藏數量多就使用堆藏，數量少就使用隙藏。3、氣調冷藏：選擇棵大、顏色鮮艷的健康香菜，做好加工和預冷工作，保證香菜的商品價值及貯藏能力。
一、凍藏法
1、凍藏一般多用于東北地區。首先要在背風處挖深一條30cm、寬80cm左右的溝；然后沿著溝挖出兩條深22厘米左右的通風道，在通風道內適當放置些秸稈；再把香菜放在秸稈上準備凍藏。
2、香菜在收獲后要清洗香菜上的土壤，去除黃葉，按一捆一斤的規格擺放在溝里。放置后，在香菜上覆蓋一層沙土和秸稈。隨著溫度的下降，再覆蓋兩次左右的覆蓋物。溝的溫度保持在5度左右，以香菜葉凍結，根不凍結為宜，一般可以貯藏到第二年春天。
二、窖藏法
1、香菜的窖藏分為堆藏與隙藏，貯藏數量多的話使用堆藏，數量少則以隙藏為主。進行堆藏時，將香菜堆在里通風口較近的地方，既能通風，又能防止溫度過高；然后在溫度下降后，將香菜移到窖內，堆藏高度保持在28厘米。隙藏就是在白菜等蔬菜貯藏的縫隙中進行貯藏。
2、貯藏白菜的溫度一般在0度左右，白菜的含水量比較多，所以非常適合香菜的貯藏。再進行窖藏時，要注意控制溫度，溫度不能高于5度，否則香菜葉片容易黃化腐爛。
三、氣調冷藏
1、氣調冷藏應選擇棵大、色彩鮮艷的健康香菜。在采收香菜時，根部保留1.8厘米左右，收獲后注意溫度，做好加工，摘除黃葉、腐爛的葉子。然后，一捆一斤的規格捆好，做好預冷工作。在溫度為0的環境下預冷約20小時。
2、在香菜溫度為0時進行裝袋，袋子以聚乙烯膜為主。然后，必須控制好袋內的空氣比例，例如氧含量保持在10.5%左右，溫度保持在0度左右，不能過低，以保證香菜的商品價值和貯藏能力。使用氣調冷藏通常可以儲存到第二年的5月左右。
